全球首个对叶榕完整基因组发布
记者4月9日从中国农业科学院获悉，全球首个榕属植物对叶榕端粒到端粒完整基因组发布，修正了原有基因组中存在的多个间隙和组装错误，大幅提升了对叶榕基因组的连续性、完整性和准确性。相关研究成果日前发表在国际期刊《园艺研究》上。
榕树是桑科榕属800多种植物的统称，广泛分布于热带和亚热带地区，榕属植物包含6个亚属，其中对叶榕属于聚果榕亚属，是典型的功能雌雄异株植物。然而，对叶榕原有基因组中存在大量的信息缺失和组装错误，阻碍了科研人员的进一步研究。
论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员张兴坦告诉记者，该所农业基因组学技术研发与应用创新团队综合利用多种测序技术，在原有基因组基础上重新组装、完善，发布了首个榕属植物对叶榕端粒到端粒完整基因组。该基因组大小为371.8兆，所有序列均挂载到14条染色体上，并准确解析了26642个编码蛋白基因。经评估，该基因组完整度达98.7%，大幅提升了对叶榕基因组的连续性和准确性。
在此基础上，研究人员进一步构建了对叶榕雄性和雌性花不同发育时期的基因调控网络，并鉴定得到了雄花发育的关键基因，为研究榕属植物重要特征和性别决定提供了重要资源。
“通过这项研究，我们不仅能更深入地理解榕树的性别演变和关键生物学特性，还成功发现了可能的性别决定基因。同时，此次研究通过基因调控网络，揭示了这些基因调控榕树的性别表达和花发育过程，为植物性别决定机制和发育生物学提供了新的理论基础。”论文第一作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所博士后廖振阳表示。
记者4月9日从中国农业科学院获悉，全球首个榕属植物对叶榕端粒到端粒完整基因组发布，修正了原有基因组中存在的多个间隙和组装错误，大幅提升了对叶榕基因组的连续性、完整性和准确性。相关研究成果日前发表在国际期刊《园艺研究》上。
榕树是桑科榕属800多种植物的统称，广泛分布于热带和亚热带地区，榕属植物包含6个亚属，其中对叶榕属于聚果榕亚属，是典型的功能雌雄异株植物。然而，对叶榕原有基因组中存在大量的信息缺失和组装错误，阻碍了科研人员的进一步研究。
论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员张兴坦告诉记者，该所农业基因组学技术研发与应用创新团队综合利用多种测序技术，在原有基因组基础上重新组装、完善，发布了首个榕属植物对叶榕端粒到端粒完整基因组。该基因组大小为371.8兆，所有序列均挂载到14条染色体上，并准确解析了26642个编码蛋白基因。经评估，该基因组完整度达98.7%，大幅提升了对叶榕基因组的连续性和准确性。
在此基础上，研究人员进一步构建了对叶榕雄性和雌性花不同发育时期的基因调控网络，并鉴定得到了雄花发育的关键基因，为研究榕属植物重要特征和性别决定提供了重要资源。
“通过这项研究，我们不仅能更深入地理解榕树的性别演变和关键生物学特性，还成功发现了可能的性别决定基因。同时，此次研究通过基因调控网络，揭示了这些基因调控榕树的性别表达和花发育过程，为植物性别决定机制和发育生物学提供了新的理论基础。”论文第一作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所博士后廖振阳表示。
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