鹿科动物肠道微生物组数据库建立
记者7月14日从中国科学院西北高原生物研究所获悉，该所动物生态与资源保护研究团队首次构建了涵盖多个物种的鹿科动物肠道宏基因组图谱，建立了当前最为系统、全面的鹿科动物肠道微生物组数据库。相关研究成果日前发表于学术期刊《BMC生物学》。
青藏高原具有极端低氧、低温以及营养匮乏等特殊环境条件，对野生动物的生存构成了严峻挑战。肠道微生物作为宿主适应外部环境的重要“隐形器官”，在能量代谢、营养吸收、免疫调节等方面发挥着关键作用。
中国科学院西北高原生物研究所动物生态与资源保护研究团队研究员张同作介绍，研究团队采集了青藏高原地区多种鹿科动物的粪便样本，并结合公共数据库中平原地区鹿科动物的样本进行分析。通过宏基因组组装，研究团队共获得了41847个宏基因组组装基因组，并构建了3193个高质量物种水平基因组，建立了目前最为系统、全面的鹿科动物肠道微生物组数据库。
张同作介绍，这是国内外首个基于多物种、大规模宏基因组分析构建的鹿科动物肠道微生物资源库，为微生物资源利用以及濒危物种保护提供了坚实的数据基础。
张同作介绍，通过系统发育和共进化分析发现，肠道微生物与宿主在长期演化过程中形成了稳定的互利关系。更为关键的是，通过比较宏基因组分析，研究人员发现高原鹿科动物的肠道微生物在能量代谢与碳水化合物活性酶通路上具有显著的适应性增强，其相关功能基因的相对丰度显著高于平原鹿类。
记者7月14日从中国科学院西北高原生物研究所获悉，该所动物生态与资源保护研究团队首次构建了涵盖多个物种的鹿科动物肠道宏基因组图谱，建立了当前最为系统、全面的鹿科动物肠道微生物组数据库。相关研究成果日前发表于学术期刊《BMC生物学》。
青藏高原具有极端低氧、低温以及营养匮乏等特殊环境条件，对野生动物的生存构成了严峻挑战。肠道微生物作为宿主适应外部环境的重要“隐形器官”，在能量代谢、营养吸收、免疫调节等方面发挥着关键作用。
中国科学院西北高原生物研究所动物生态与资源保护研究团队研究员张同作介绍，研究团队采集了青藏高原地区多种鹿科动物的粪便样本，并结合公共数据库中平原地区鹿科动物的样本进行分析。通过宏基因组组装，研究团队共获得了41847个宏基因组组装基因组，并构建了3193个高质量物种水平基因组，建立了目前最为系统、全面的鹿科动物肠道微生物组数据库。
张同作介绍，这是国内外首个基于多物种、大规模宏基因组分析构建的鹿科动物肠道微生物资源库，为微生物资源利用以及濒危物种保护提供了坚实的数据基础。
张同作介绍，通过系统发育和共进化分析发现，肠道微生物与宿主在长期演化过程中形成了稳定的互利关系。更为关键的是，通过比较宏基因组分析，研究人员发现高原鹿科动物的肠道微生物在能量代谢与碳水化合物活性酶通路上具有显著的适应性增强，其相关功能基因的相对丰度显著高于平原鹿类。
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