研究解析节节麦遗传渗入规律及小麦抗逆关键基因
节节麦作为普通小麦D基因组的二倍体祖先种，蕴藏丰富的抗逆和品质改良基因资源，是拓展小麦遗传多样性的重要基因库。由于不同节节麦谱系之间存在显著的基因组结构差异，且多数参考基因组来源于未直接参与育种利用的野生材料，导致育种过程中实际利用的优异供体片段难以精准追踪，限制了节节麦遗传资源的有效挖掘。
近日，中国科学院西北高原生物研究所研究团队利用长读长测序和Hi-C技术，对节节麦材料AS60进行了染色体水平基因组组装。研究获得了大小约3.94Gb的AS60参考基因组，共锚定7条D基因组染色体，注释获得45,645个蛋白编码基因，BUSCO完整性达到96.4%。
研究发现，不同育种材料保留的AS60来源片段存在显著差异，其中SM969保留了最多的AS60遗传片段，总长度达到约1.73Gb，而不同品种之间的渗入区域表现出明显的染色体偏向性。特别是在3D和5D染色体区域，多个育种材料均表现出较高频率的AS60片段保留，形成潜在的优异基因富集区域。
通过QTL定位、根系转录组分析、加权基因共表达网络分析以及候选基因功能筛选，研究锁定了位于AS60来源片段中的乙烯响应因子基因ERF8-1D。研究利用EMS突变材料进行功能验证发现，erf8功能缺失突变体在水涝胁迫下表现出明显降低的耐受能力，证明ERF8-1D是调控小麦抗涝性的关键基因。
该研究以育种实践中广泛利用的节节麦材料AS60为研究对象，构建了染色体水平高质量D基因组参考序列，建立了基于供体特异单倍型的遗传渗入解析体系，系统揭示了节节麦来源遗传片段在小麦育种材料中的保留规律，并鉴定出调控小麦抗逆关键候选基因ERF8-1D。
相关研究成果发表在《作物学报》（The Crop Journal）上。研究工作得到青海省重点研发项目的支持。
论文链接
ERF8-1D机制模型
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